交通运输系下设汽车运用与维修、城市轨道交通车辆运用与检修、通用航空器维修和飞行技术与航务管理四个专业。
　　汽车运用与维修专业是全国示范专业、北京市特色高水平骨干专业，北京市示范专业、北京市职业院校创新团队、北京理工大学全国重点建设职业教育师资培训基地。与上汽大众汽车有限公司和华晨宝马汽车有限公司合作，成立了在京唯一的上汽大众SCEP和宝马集团BEST的北京培训基地，成立了企业品牌订单班。建有国家一类汽车维修企业资质、示范级水平的校内生产性实训基地，面积8150㎡，设备价值3100万。90%以上毕业生进入高端汽车市场就业；学生就业满意率达到95%以上。在全国职业院校技能大赛（中职组）中荣获21个奖项。2015、2016、2017年学生谢景辉、许鹤鸣、宿昊宗连续3年获得全国职业院校技能大赛中职组车身修复项目冠军。
　　通用航空器维修、飞行技术与航务管理两个专业与华彬天星通航有限公司进行校企合作，产教深度融合，推进“学培互融，育训结合”的人才培养模式改革，建有符合国家民航局CCAR147培训机构要求综合训练基地，拥有200余台机务维修实训设备、训练用飞机、飞行驾驶模拟训练器等实训设备，可提供国家标准的机务维修培训和相关飞行及航务管理社会培训及科普教育活动。
　　城市轨道交通车辆运用与检修专业建有500㎡的城市轨道交通车辆检修综合训练基地，设备总值达到454万，可开设轨道车辆模拟驾驶、地铁车辆调度、线路检测、屏蔽门维修等项目实训。学生在北京市职业院校技能大赛（中职组）中荣获7个奖项。
　　我系拥有一支优秀的教师团队，教师全部具有中高级技术职称，30%具有硕士研究生以上学历，专业教师全部拥有企业实践经历，理论功底扎实，教学与实践经验丰富。
　　我系与北京工业职业技术学院、北京交通运输职业学院、北京交通职业技术学院、比较电子科技职业学院、国家开放大学等开展合作办学，进行五年一贯制和3+2中高职联合培养，为学生开辟了更多发展的新途径。